蛋白脱酰胺预测工具
在线预测蛋白序列中的脱酰胺位点及其风险分数
什么是氨基酸脱酰胺?
氨基酸脱酰胺是指蛋白质中的天冬酰胺(Asn, N)和谷氨酰胺(Gln, Q)残基的酰胺基发生水解,生成天冬氨酸(Asp, D)和谷氨酸(Glu, E)的过程。这是一种常见的蛋白质翻译后修饰,可能影响蛋白质的结构和功能。
哪些氨基酸残基和序列容易发生脱酰胺?
- 天冬酰胺(Asn, N):尤其是当它后面连接小侧链或极性残基时,如NG、NS、NT、NA、NH等序列
- 谷氨酰胺(Gln, Q):仅在长寿命蛋白或强应激条件下显著发生,如QG、QS等序列
什么环境下会出现脱酰胺?
- pH条件:酸性(3<pH<5)和中性/碱性(5<pH<8)条件下容易发生
- 温度:高温会加速脱酰胺反应
- 结构因素:位于柔性区或环区的敏感序列更容易发生脱酰胺
预测结果(低风险<5,5≤中等风险<20,20≤高风险)